1999 yılında Japonya’da yaşanan nükleer felaket sonucu tehlikeli kabul edilen bölgeye halkın girişi yasaklanır. Ancak halka deprem olarak gösterilen felaketin, gösterildiğinden daha fazlası olduğunu iddia eden Amerikalı Joe Brody bir süre sonra, önceden yaşanan bir felaketetin yine tekrarlandığını anlar. Nükleer enerjiden beslenen bir yaratık, çevrede yıkım izleri bırakmıştır. Canavarı durdurmak için ulusal güçler ve Amerikan ordusu harekete geçtiğinde uykusundan uyanmasına ramak kalan Godzilla’yı farkederler. Dev yaratık intikamını almak için uyanmayı beklemektedir.